データベースの説明
| # | 項目 | 説明 | |
|---|---|---|---|
| 1 | 名称 | GETDB | |
| 2 | 別名 | Gal4 Enhancer Trap Insertion Database | |
| 3 | 作成者（所属）（*は代表者） | *林 茂生(理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター) | |
| 4 | データベース運用場所 | 京都工芸繊維大学 ショウジョウバエ遺伝資源研究センター | |
| 5 | 連絡先 |
〒650-0047 兵庫県神戸市中央区港島南町2-2-3 発生再生科学総合研究センター 形態形成シグナル研究グループ Tel: 078-306-3185 / FAX: 078-306-3183 E-mail:  |
|
| 6 | オリジナルサイト | http://kyotofly.kit.jp/stocks/GETDB/getdb.html | |
| 7 | 統括サイト | http://www.dgrc.jp/flystock/index_e.html | |
| 8 | 一覧表示 | 有り | |
| 9 | クエリ検索 | 有り | |
| 10 | Webサービス | 無し | |
| 11 | ユーザ登録 | 無し | |
| 12 | データのファイルダウンロード | ||
| 13 | 説明 | ショウジョウバエにおいてGal4-UAS法に基づくエンハンサートラップ系統をNPコンソーシアムとして約４６００の挿入系統を作成し、 それらのすべてについてエンハンサー活性を胚および幼虫において検定した。 また挿入位置をゲノム配列上にマップして遺伝子との対応関係を２１５７カ所の独立したサイトについて明らかにした。 本データベースはGal4エンハンサートラップ系統の挿入位置とエンハンサー活性のパターンをまとめたデータベースとして公開されている。 | |
| 14 | データベース分類 | 変異体・表現型 | |
| ゲノムデータベース（無脊椎動物）-無脊椎動物ゲノムデータベース | |||
| 15 | 生物種 | Drosophila melanogaster(Taxonomy ID: 7227 ) | |
| 16 | 参照先 | FlyBase | |
| 17 | 運用開始年月日 | 2003/8/1 | |
| 18 | 最終更新年月 | 2009/9/4 | |
| 19 | 背景・プロジェクト | 文部科学省 ゲノム特定研究(2000～2004年度）、 日本学術振興会 未来開拓学術研究推進事業 | |
| 20 | データベースの特長・有用性・活用方法 | 系統については国立遺伝学研究所と京都工芸繊維大学ショウジョウバエ遺伝資源センターにおいて維持、配布されている。 | |
| 21 | 論文等 | 文献名 | GETDB, a database compiling expression patterns and molecular locations of a collection of Gal4 enhancer traps. |
| 著者名 | Hayashi S, Ito K, Sado Y, Taniguchi M, Akimoto A, Takeuchi H, Aigaki T, Matsuzaki F, Nakagoshi H, Tanimura T, Ueda R, Uemura T, Yoshihara M, Goto S. | ||
| 雑誌名/掲載年月/号 | Genesis. 2002 Sep-Oct;34(1-2):58-61. | ||
| Pubmed ID | 12324948 | ||
GETDB | データ内容
データ1| # | 項目 | 説明 |
|---|---|---|
| 1 | データ内容 | ショウジョウバエGAL4エンハンサートラップ系統のデータ |
| 2 | データソース | 実験 |
| 3 | データ取得方法 | |
| 4 | 解析方法 | |
| 5 | 登録件数 | 4,250件 |
データ2
| # | 項目 | 説明 |
|---|---|---|
| 1 | データ内容 | ショウジョウバエGAL4エンハンサートラップ系統の発現画像データ |
| 2 | データソース | 実験 |
| 3 | データ取得方法 | |
| 4 | 解析方法 | |
| 5 | 登録件数 | 3,075件 |
データ3
| # | 項目 | 説明 |
|---|---|---|
| 1 | データ内容 | ショウジョウバエGAL4エンハンサートラップ系統の挿入部位の下流配列データ |
| 2 | データソース | 実験 |
| 3 | データ取得方法 | |
| 4 | 解析方法 | |
| 5 | 登録件数 | 5,555件 |
データ4
| # | 項目 | 説明 |
|---|---|---|
| 1 | データ内容 | ショウジョウバエGAL4エンハンサートラップ系統の挿入部位の配列データのゲノムマッピングデータ |
| 2 | データソース | データベース内のデータ |
| 3 | データ取得方法 | Blastによるマッピング（Berkeley Drosophila Genome Project（BDGP）/Celeraによって決定されたゲノム配列 (Release 3.1)をターゲット配列としてマッピング） |
| 4 | 解析方法 | |
| 5 | 登録件数 | 2,099件 |
